どうして汚れが取れなくなるのですか?

酸性雨や水道水に含まれる酸が、空気中の粉塵と混ざりながら、ガラス表面の成分を溶かし、ガラス自体に汚れが溶込むので普通に洗っても、取れなくなるのです。

細かい表面キズも取れるのですか?

キズ自体は取ることができません。ガラスの表面キズを取るには、キズ取り作業があります。キズの部分に業務用キズ取りマシンと専用研磨剤を併用し、ヒズミを分散しながら研磨します。但し、軽傷については効果がありますが、重傷（爪が引っ掛かる程度の深さ）の除去には効果が得られません。

クリーニングの後、油膜は付かないんですか?

油膜を付かなくするには、別料金になりますが、クリーニングと同時に撥水コートをすれば、ガラス表面に撥水被膜を作り、汚れが落ちやすくなります。